CoChat
Sign Up
Cited by 306SARS-CoV-2 and COVID-19 ResearchComputational Drug Discovery MethodsCOVID-19 Clinical Research Studies

Drug Development and Medicinal Chemistry Efforts toward SARS‐Coronavirus and Covid‐19 Therapeutics

Open access
Ghosh, Arun K., Brindisi, Margherita, Shahabi, Dana, Chapman, Mackenzie E., Mesecar, Andrew D.·2020·ChemMedChem
DOI 10.1002/cmdc.202000223PMC PMC7264561
Open this paper in CoChat — free accountOpen PDF

Abstract

The COVID‐19 pandemic caused by SARS‐CoV‐2 infection is spreading at an alarming rate and has created an unprecedented health emergency around the globe. There is no effective vaccine or approved drug treatment against COVID‐19 and other pathogenic coronaviruses. The development of antiviral agents is an urgent priority. Biochemical events critical to the coronavirus replication cycle provided a number of attractive targets for drug development. These include, spike protein for binding to host cell‐surface receptors, proteolytic enzymes that are essential for processing polyproteins into mature viruses, and RNA‐dependent RNA polymerase for RNA replication. There has been a lot of ground work for drug discovery and development against these targets. Also, high‐throughput screening efforts have led to the identification of diverse lead structures, including natural product‐derived molecules. This review highlights past and present drug discovery and medicinal‐chemistry approaches against SARS‐CoV, MERS‐CoV and COVID‐19 targets. The review hopes to stimulate further research and will be a useful guide to the development of effective therapies against COVID‐19 and other pathogenic coronaviruses.

The claims and statistics of this paper haven’t been checked yet.

Run the check — free, no account needed. It reads the open-access text and checks the sources it cites.

A few free checks a day · papers already verified open instantly · results are public

Integrity signals

Registry

Crossref · 10.1002/cmdc.202000223

Cites

Statistics

Claims the paper makes

The claims and statistics of this paper haven’t been checked yet.

Run the check — free, no account needed. It reads the open-access text and checks the sources it cites.

A few free checks a day · papers already verified open instantly · results are public

Claims other papers make about this one

Each is checked against this paper’s own text: does it say what the citing paper says it does?

  • SARS-CoV-2 catalytic virulence factors, such as its two proteases, Mpro and PLpro, and the RNA-dependent RNA polymerase (Rdrp), are potentially targetable by a PROTAC.

    “but SARS-CoV-2 catalytic virulence factors, such as its two proteases, Mpro and PLpro201, and the RNA-dependent RNA polymerase (Rdrp), which is the target of remdesivir202, are potentially targetable by a PROTAC.”

    From PROTAC targeted protein degraders: the past is prologue (2022) · cites this paper as [201]

Self-check

Percentages, sums and reported differences re-computed from the paper’s own numbers.

The self-check needs the paper’s full text.

The citation lists haven’t been fetched yet

References 170 · Cited by 306

Research works printed but not linked: 147

  1. [1]F. Wu, S. Zhao, B. Yu, Y M. Chen, W. Wang, Z. G. Song, Y. Hu, Z. W. Tao, J. H. Tian, Y. Y. Pei, M. L. Yuan, Y. L. Zhang, F. H. Dai, Y. Liu, Q. M. Wang, J. J. Zheng, L. Xu, E. C. Holmes, Y. Z. Zhang, Nature 2020 , 579 , 265-269.
  2. [2]P. Zhou, X. L. Yang, X. G. Wang, B. Hu, L. Zhang, W. Zhang, H. R. Si, Y. Zhu, B. Li, C. L. Huang, H. D. Chen, J. Chen, Y. Luo, H. Guo, R. D. Jiang, M. Q. Liu, Y. Chen, X. R. Shen, X. Wang, X. S. Zheng, K. Zhao, Q. J. Chen, F. Deng, L. L. Liu, B. Yan, F. X. Zhan, Y. Y. Wang, G. F. Xiao, Z. L. Shi, Nature 2020 , 579 , 270-273.
  3. [3]Y. Wu, W. Ho, Y. Huang, D. Y. Jin, S. Li, S. L. Liu, X. Liu, J. Qiu, Y. Sang, Q. Wang, K. Y. Yuen, Z. M. Zheng, Lancet 2020 , 395 , 949-950.
  4. [6]C. Huang, Y. Wang, X. Li, L. Ren, J. Zhao, Y. Hu, L. Zhang, G. Fan, J. Xu, X. Gu, Z. Cheng, T. Yu, J. Xia, Y. Wei, W. Wu, X. Xie, W. Yin, H. Li, M. Liu, Y. Xiao, H. Gao, L. Guo, J. Xie, G. Wang, R. Jiang, Z. Gao, Q. Jin, J. Wang, B. Cao, Lancet 2020 , 395 , 497-506.
  5. [7]J. S. Kahn, K. McIntosh, Pediatr. Infect. Dis. J. 2005 , 24 , S223-227, discussion S226.
  6. [8]N. R. Sexton, E. C. Smith, H. Blanc, M. Vignuzzi, O. B. Peersen, M. R. Denison, J. Virol. 2016 , 90 , 7415-7428.
  7. [10]A. Zumla, D. S. Hui, S. Perlman, Lancet 2015 , 386 , 995-1007.
  8. [11]J. S. Peiris, Y. Guan, K. Y. Yuen, Nat. Med. 2004 , 10 , S88-97.
  9. [12]K. Pyrc, B. Berkhout, L. van der Hoek, Expert. Rev. Anti. Infect. Ther. 2007 , 5 , 245-253.
  10. [13]C. Drosten, S. Gunther, W. Preiser, S. van der Werf, H. R. Brodt, S. Becker, H. Rabenau, M. Panning, L. Kolesnikova, R. A. Fouchier, A. Berger, A. M. Burguiere, J. Cinatl, M. Eickmann, N. Escriou, K. Grywna, S. Kramme, J. C. Manuguerra, S. Muller, V. Rickerts, M. Sturmer, S. Vieth, H. D. Klenk, A. D. Osterhaus, H. Schmitz, H. W. Doerr, N. Engl. J. Med. 2003 , 348 , 1967-1976.
  11. [14]M. D. Christian, S. M. Poutanen, M. R. Loutfy, M. P. Muller, D. E. Low, Clin. Infect Dis. 2004 , 38 , 1420-1427.
  12. [15]Z. A. Memish, A. I. Zumla, R. F. Al-Hakeem, A. A. Al-Rabeeah, G. M. Stephens, N. Engl. J. Med. 2013 , 368 , 2487-2494.
  13. [18]I. Eckerle, M. A. Muller, S. Kallies, D. N. Gotthardt, C. Drosten, Virol. J. 2013 , 10 , 359.
  14. [21]J. S. Morse, T. Lalonde, S. Xu, W. R. Liu, ChemBioChem 2020 , 21 , 730738.
  15. [22]N. Dong, X. Yang, L. Ye, K. Chen, E. Wai-Chi Chan, M. Yang, S. Chen, bioRxiv 2020 , DOI:10.1101/2020.1101.1120.913368. · DOI
  16. [23]P. V. Baranov, C. M. Henderson, C. B. Anderson, R. F. Gesteland, J. F. Atkins, M. T. Howard, Virology 2005 , 332 , 498-510.
  17. [24]J. Ziebuhr, E. J. Snijder, A. E. Gorbalenya, J. Gen. Virol. 2000 , 81 , 853879.
  18. [25]X. Xu, Y. Liu, S. Weiss, E. Arnold, S. G. Sarafianos, J. Ding, Nucl. Acids. Res. 2003 , 31 , 7117-7130.
  19. [26]D. Forni, R. Cagliani, M. Clerici, M. Sironi, Trends Microbiol. 2017 , 25 , 3548.
  20. [29]Stevens, A. D. Mesecar, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006 , 103 , 5717-5722. [29] R. L. Graham, J. S. Sparks, L. D. Eckerle, A. C. Sims, M. R. Denison, Virus Res. 2008 , 133 , 88-100.
  21. [30]A. Kanjanahaluethai, Z. Chen, D. Jukneliene, S. C. Baker, Virology 2007 , 361 , 391-401.
  22. [31]K. Ratia, S. Pegan, J. Takayama, K. Sleeman, M. Coughlin, S. Baliji, R. Chaudhuri, W. Fu, B. S. Prabhakar, M. E. Johnson, S. C. Baker, A. K. Ghosh, A. D. Mesecar, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008 , 105 , 1611916124.
  23. [32]A. K. Ghosh, K. Xi, V. Grum-Tokars, X. Xu, K. Ratia, W. Fu, K. V. Houser, S. C. Baker, M. E. Johnson, A. D. Mesecar, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2007 , 17 , 5876-5880.
  24. [33]X. Deng, S. E. StJohn, H. L. Osswald, A. O ' Brien, B. S. Banach, K. Sleeman, A. K. Ghosh, A. D. Mesecar, S. C. Baker, J. Virol. 2014 , 88 , 11886-11898.
  25. [34]V. Thiel, K. A. Ivanov, A. Putics, T. Hertzig, B. Schelle, S. Bayer, B. Weissbrich, E. J. Snijder, H. Rabenau, H. W. Doerr, A. E. Gorbalenya, J. Ziebuhr, J. Gen. Virol. 2003 , 84 , 2305-2315.
  26. [35]H. Yang, M. Yang, Y. Ding, Y. Liu, Z. Lou, Z. Zhou, L. Sun, L. Mo, S. Ye, H. Pang, G. F. Gao, K. Anand, M. Bartlam, R. Hilgenfeld, Z. Rao, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003 , 100 , 13190-13195.
  27. [36]T. Muramatsu, C. Takemoto, Y. T. Kim, H. Wang, W. Nishii, T. Terada, M. Shirouzu, S. Yokoyama, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2016 , 113 , 1299713002.
  28. [37]K. Ratia, A. Mesecar, A. O'Brien, S. C. Baker in Handbook of Proteolytic Enzymes Elsevier, 2013 , pp. 2195-2199.
  29. [38]Y. M. Baez-Santos, A. M. Mielech, X. Deng, S. Baker, A. D. Mesecar, J. Virol. 2014 , 88 , 12511-12527.
  30. [39]K. Ratia, A. Kilianski, Y. M. Baez-Santos, S. C. Baker, A. Mesecar, PLoS Pathog. 2014 , 10 , e1004113.
  31. [40]X. Chen, C. Y. Chou, G. G. Chang, Antivir. Chem. Chemother. 2009 , 19 , 151-156.
  32. [41]J. Y. Park, J. A. Ko, D. W. Kim, Y. M. Kim, H. J. Kwon, H. J. Jeong, C. Y. Kim, K. H. Park, W. S. Lee, Y. B. Ryu, J. Enzyme Inhib. Med. Chem. 2016 , 31 , 23-30.
  33. [42]Y. Zhou, P. Vedantham, K. Lu, J. Agudelo, R. Carrion, Jr., J. W. Nunneley, D. Barnard, S. Pohlmann, J. H. McKerrow, A. R. Renslo, G. Simmons, Antiviral. Res. 2015 , 116 , 76-84.
  34. [44]C. N. Chen, C. P. Lin, K. K. Huang, W. C. Chen, H. P. Hsieh, P. H. Liang, J. T. Hsu, Evid. Based Complement Alternat. Med. 2005 , 2 , 209-215.
  35. [45]K. Fan, P. Wei, Q. Feng, S. Chen, C. Huang, L. Ma, B. Lai, J. Pei, Y. Liu, J. Chen, L. Lai, J. Biol. Chem. 2004 , 279 , 1637-1642.
  36. [47]V. Grum-Tokars, K. Ratia, A. Begaye, S. C. Baker, A. D. Mesecar, Virus Res. 2008 , 133 , 63-73.
  37. [48]U. Bacha, J. Barrila, A. Velazquez-Campoy, S. A. Leavitt, E. Freire, Biochemistry 2004 , 43 , 4906-4912.
  38. [49]V. Graziano, W. J. McGrath, A. M. DeGruccio, J. J. Dunn, W. F. Mangel, FEBS Lett. 2006 , 580 , 2577-2583.
  39. [50]R. Y. Kao, A. P. To, L. W. Ng, W. H. Tsui, T. S. Lee, H. W. Tsoi, K. Y. Yuen, FEBS Lett. 2004 , 576 , 325-330.
  40. [51]C. J. Kuo, Y. H. Chi, J. T. Hsu, P. H. Liang, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004 , 318 , 862-867.
  41. [52]S. E. St John, M. D. Therkelsen, P. R. Nyalapatla, H. L. Osswald, A. K. Ghosh, A. D. Mesecar, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2015 , 25 , 5072-5077.
  42. [53]S. E. St John, S. Tomar, S. R. Stauffer, A. D. Mesecar, Bioorg. Med. Chem. 2015 , 23 , 6036-6048.
  43. [54]S. Tomar, M. L. Johnston, S. E. St John, H. L. Osswald, P. R. Nyalapatla, L. N. Paul, A. K. Ghosh, M. R. Denison, A. D. Mesecar, J. Biol. Chem. 2015 , 290 , 19403-19422.
  44. [55]A. K. Ghosh, K. Xi, K. Ratia, B. D. Santarsiero, W. Fu, B. H. Harcourt, P. A. Rota, S. C. Baker, M. E. Johnson, A. D. Mesecar, J. Med. Chem. 2005 , 48 , 6767-6771.
  45. [56]J. Jacobs, V. Grum-Tokars, Y. Zhou, M. Turlington, S. A. Saldanha, P. Chase, A. Eggler, E. S. Dawson, Y. M. Baez-Santos, S. Tomar, A. M. Mielech, S. C. Baker, C. W. Lindsley, P. Hodder, A. Mesecar, S. R. Stauffer, J. Med. Chem. 2013 , 56 , 534-546.
  46. [57]L. Zhu, S. George, M. F. Schmidt, S. I. Al-Gharabli, J. Rademann, R. Hilgenfeld, Antiviral. Res. 2011 , 92 , 204-212.
  47. [58]A. K. Ghosh, G. Gong, V. Grum-Tokars, D. C. Mulhearn, S. C. Baker, M. Coughlin, B. S. Prabhakar, K. Sleeman, M. E. Johnson, A. D. Mesecar, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008 , 18 , 5684-5688.
  48. [59]J. R. Clasman, Y. M. Baez-Santos, R. C. Mettelman, A. O ' Brien, S. C. Baker, A. D. Mesecar, Sci. Rep. 2017 , 7 , 40292.
  49. [60]Y. M. Baez-Santos, S. J. Barraza, M. W. Wilson, M. P. Agius, A. M. Mielech, N. M. Davis, S. C. Baker, S. D. Larsen, A. D. Mesecar, J. Med. Chem. 2014 , 57 , 2393-2412.
  50. [61]A. K. Ghosh, J. Takayama, K. V. Rao, K. Ratia, R. Chaudhuri, D. C. Mulhearn, H. Lee, D. B. Nichols, S. Baliji, S. C. Baker, M. E. Johnson, A. D. Mesecar, J. Med. Chem. 2010 , 53 , 4968-4979.
  51. [63]Y. M. Baez-Santos, S. E. St John, A. D. Mesecar, Antiviral. Res. 2015 , 115 , 21-38.
  52. [64]K. Anand, J. Ziebuhr, P. Wadhwani, J. R. Mesters, R. Hilgenfeld, Science 2003 , 300 , 1763-1767.
  53. [65]E. J. Snijder, P. J. Bredenbeek, J. C. Dobbe, V. Thiel, J. Ziebuhr, L. L. Poon, Y. Guan, M. Rozanov, W. J. Spaan, A. E. Gorbalenya, J. Mol. Biol. 2003 , 331 , 991-1004.
  54. [66]K. Anand, G. J. Palm, J. R. Mesters, S. G. Siddell, J. Ziebuhr, R. Hilgenfeld, EMBO J. 2002 , 21 , 3213-3224.
  55. [67]A. K. Ghosh, K. Xi, M. E. Johnson, S. C. Baker, A. D. Mesecar, Annu. Rep. Med. Chem. 2007 , 41 , 183-196.
  56. [68]J. Seipelt, A. Guarne, E. Bergmann, M. James, W. Sommergruber, I. Fita, T. Skern, Virus Res. 1999 , 62 , 159-168.
  57. [69]S. Yang, S. J. Chen, M. F. Hsu, J. D. Wu, C. T. Tseng, Y. F. Liu, H. C. Chen, C. W. Kuo, C. S. Wu, L. W. Chang, W. C. Chen, S. Y. Liao, T. Y. Chang, H. H. Hung, H. L. Shr, C. Y. Liu, Y. A. Huang, L. Y. Chang, J. C. Hsu, C. J. Peters, A. H. Wang, M. C. Hsu, J. Med. Chem. 2006 , 49 , 4971-4980.
  58. [70]T. Regnier, D. Sarma, K. Hidaka, U. Bacha, E. Freire, Y. Hayashi, Y. Kiso, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009 , 19 , 2722-2727.
  59. [71]S. Konno, P. Thanigaimalai, T. Yamamoto, K. Nakada, R. Kakiuchi, K. Takayama, Y. Yamazaki, F. Yakushiji, K. Akaji, Y. Kiso, Y. Kawasaki, S. E. Chen, E. Freire, Y. Hayashi, Bioorg. Med. Chem. 2013 , 21 , 412-424.
  60. [72]P. Thanigaimalai, S. Konno, T. Yamamoto, Y. Koiwai, A. Taguchi, K. Takayama, F. Yakushiji, K. Akaji, Y. Kiso, Y. Kawasaki, S. E. Chen, A. Naser-Tavakolian, A. Schon, E. Freire, Y. Hayashi, Eur J. Med. Chem. 2013 , 65 , 436-447.
  61. [73]P. Thanigaimalai, S. Konno, T. Yamamoto, Y. Koiwai, A. Taguchi, K. Takayama, F. Yakushiji, K. Akaji, S. E. Chen, A. Naser-Tavakolian, A. Schon, E. Freire, Y. Hayashi, Eur J. Med. Chem. 2013 , 68 , 372-384.
  62. [74]V. Kumar, J. S. Shin, J. J. Shie, K. B. Ku, C. Kim, Y. Y. Go, K. F. Huang, M. Kim, P. H. Liang, Antiviral. Res. 2017 , 141 , 101-106.
  63. [75]L. Zhang, D. Lin, Y. Kusov, Y. Nian, Q. Ma, J. Wang, A. von Brunn, P. Leyssen, K. Lanko, J. Neyts, A. de Wilde, E. J. Snijder, H. Liu, R. Hilgenfeld, J. Med. Chem. 2020 , DOI: 10.1021/acs.jmedchem.1029b01828.. · DOI
  64. [76]L. Zhang, D. Lin, X. Sun, U. Curth, C. Drosten, L. Sauerhering, S. Becker, K. Rox, R. Hilgenfeld, Science 2020 , 368, 409-412.
  65. [77]T. W. Lee, M. M. Cherney, C. Huitema, J. Liu, K. E. James, J. C. Powers, L. D. Eltis, M. N. James, J. Mol. Biol. 2005 , 353 , 1137-1151.
  66. [78]J. L. Asgian, K. E. James, Z. Z. Li, W. Carter, A. J. Barrett, J. Mikolajczyk, G. S. Salvesen, J. C. Powers, J. Med. Chem. 2002 , 45 , 4958-4960.
  67. [79]J. J. Shie, J. M. Fang, T. H. Kuo, C. J. Kuo, P. H. Liang, H. J. Huang, Y. T. Wu, J. T. Jan, Y. S. Cheng, C. H. Wong, Bioorg. Med. Chem. 2005 , 13 , 5240-5252.
  68. [80]C. Y. Wu, K. Y. King, C. J. Kuo, J. M. Fang, Y. T. Wu, M. Y. Ho, C. L. Liao, J. J. Shie, P. H. Liang, C. H. Wong, Chem. Biol. 2006 , 13 , 261-268.
  69. [81]J. E. Blanchard, N. H. Elowe, C. Huitema, P. D. Fortin, J. D. Cechetto, L. D. Eltis, E. D. Brown, Chem. Biol. 2004 , 11 , 1445-1453.
  70. [82]J. Zhang, H. I. Pettersson, C. Huitema, C. Niu, J. Yin, M. N. James, L. D. Eltis, J. C. Vederas, J. Med. Chem. 2007 , 50 , 1850-1864.
  71. [83]C. Niu, J. Yin, J. Zhang, J. C. Vederas, M. N. James, Bioorg. Med. Chem. 2008 , 16 , 293-302.
  72. [85]R. P. Jain, H. I. Pettersson, J. Zhang, K. D. Aull, P. D. Fortin, C. Huitema, L. D. Eltis, J. C. Parrish, M. N. James, D. S. Wishart, J. C. Vederas, J. Med. Chem. 2004 , 47 , 6113-6116.
  73. [86]J. J. Shie, J. M. Fang, C. J. Kuo, T. H. Kuo, P. H. Liang, H. J. Huang, W. B. Yang, C. H. Lin, J. L. Chen, Y. T. Wu, C. H. Wong, J. Med. Chem. 2005 , 48 , 4469-4473.
  74. [87]K. Akaji, H. Konno, H. Mitsui, K. Teruya, Y. Shimamoto, Y. Hattori, T. Ozaki, M. Kusunoki, A. Sanjoh, J. Med. Chem. 2011 , 54 , 7962-7973.
  75. [88]Y. Shimamoto, Y. Hattori, K. Kobayashi, K. Teruya, A. Sanjoh, A. Nakagawa, E. Yamashita, K. Akaji, Bioorg. Med. Chem. 2015 , 23 , 876890.
  76. [89]S. I. Yoshizawa, Y. Hattori, K. Kobayashi, K. Akaji, Bioorg. Med. Chem. 2020 , 28 , 115273.
  77. [90]C. Y. Wu, J. T. Jan, S. H. Ma, C. J. Kuo, H. F. Juan, Y. S. Cheng, H. H. Hsu, H. C. Huang, D. Wu, A. Brik, F. S. Liang, R. S. Liu, J. M. Fang, S. T. Chen, P. H. Liang, C. H. Wong, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004 , 101 , 1001210017.
  78. [91]Y. M. Shao, W. B. Yang, H. P. Peng, M. F. Hsu, K. C. Tsai, T. H. Kuo, A. H. Wang, P. H. Liang, C. H. Lin, A. S. Yang, C. H. Wong, ChemBioChem 2007 , 8 , 1654-1657.
  79. [31]Brown, D. M. DeLisle, C. E. Ford, S. L. Binford, J. Med. Chem. 1996 , 39 , 5072-5082.
  80. [93]L. R. Chen, Y. C. Wang, Y. W. Lin, S. Y. Chou, S. F. Chen, L. T. Liu, Y. T. Wu, C. J. Kuo, T. S. Chen, S. H. Juang, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2005 , 15 , 3058-3062.
  81. [94]L. Zhou, Y. Liu, W. Zhang, P. Wei, C. Huang, J. Pei, Y. Yuan, L. Lai, J. Med. Chem. 2006 , 49 , 3440-3443.
  82. [95]W. Liu, H. M. Zhu, G. J. Niu, E. Z. Shi, J. Chen, B. Sun, W. Q. Chen, H. G. Zhou, C. Yang, Bioorg. Med. Chem. 2014 , 22 , 292-302.
  83. [96]H. Z. Zhang, H. Zhang, W. Kemnitzer, B. Tseng, J. Cinatl Jr., M. Michaelis, H. W. Doerr, S. X. Cai, J. Med. Chem. 2006 , 49 , 1198-1201.
  84. [97]R. Ramajayam, K. P. Tan, H. G. Liu, P. H. Liang, Bioorg. Med. Chem. 2010 , 18 , 7849-7854.
  85. [98]R. Ramajayam, K. P. Tan, H. G. Liu, P. H. Liang, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2010 , 20 , 3569-3572.
  86. [99]R. Y. Kao, W. H. Tsui, T. S. Lee, J. A. Tanner, R. M. Watt, J. D. Huang, L. Hu, G. Chen, Z. Chen, L. Zhang, T. He, K. H. Chan, H. Tse, A. P. To, L. W. Ng, B. C. Wong, H. W. Tsoi, D. Yang, D. D. Ho, K. Y. Yuen, Chem. Biol. 2004 , 11 , 1293-1299.
  87. [100]K. C. Tsai, S. Y. Chen, P. H. Liang, I. L. Lu, N. Mahindroo, H. P. Hsieh, Y. S. Chao, L. Liu, D. Liu, W. Lien, T. H. Lin, S. Y. Wu, J. Med. Chem. 2006 , 49 , 3485-3495.
  88. [101]P. Mukherjee, P. Desai, L. Ross, E. L. White, M. A. Avery, Bioorg. Med. Chem. 2008 , 16 , 4138-4149.
  89. [102]T. T. Nguyen, H. J. Ryu, S. H. Lee, S. Hwang, V. Breton, J. H. Rhee, D. Kim, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2011 , 21 , 3088-3091.
  90. [103]H. Lee, A. Mittal, K. Patel, J. L. Gatuz, L. Truong, J. Torres, D. C. Mulhearn, M. E. Johnson, Bioorg. Med. Chem. 2014 , 22 , 167-177.
  91. [104]C. C. Wen, Y. H. Kuo, J. T. Jan, P. H. Liang, S. Y. Wang, H. G. Liu, C. K. Lee, S. T. Chang, C. J. Kuo, S. S. Lee, C. C. Hou, P. W. Hsiao, S. C. Chien, L. F. Shyur, N. S. Yang, J. Med. Chem. 2007 , 50 , 4087-4095.
  92. [105]Y. B. Ryu, H. J. Jeong, J. H. Kim, Y. M. Kim, J. Y. Park, D. Kim, T. T. Nguyen, S. J. Park, J. S. Chang, K. H. Park, M. C. Rho, W. S. Lee, Bioorg. Med. Chem. 2010 , 18 , 7940-7947.
  93. [107]M. Turlington, A. Chun, S. Tomar, A. Eggler, V. Grum-Tokars, J. Jacobs, J. S. Daniels, E. Dawson, A. Saldanha, P. Chase, Y. M. Baez-Santos, C. W. Lindsley, P. Hodder, A. D. Mesecar, S. R. Stauffer, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2013 , 23 , 6172-6177.
  94. [108]T. Pillaiyar, M. Manickam, V. Namasivayam, Y. Hayashi, S. H. Jung, J. Med. Chem. 2016 , 59 , 6595-6628.
  95. [109]R. Ramajayam, K. P. Tan, P. H. Liang, Biochem. Soc. Trans. 2011 , 39 , 1371-1375.
  96. [110]I. Imbert, E. J. Snijder, M. Dimitrova, J. C. Guillemot, P. Lecine, B. Canard, Virus Res. 2008 , 133 , 136-148.
  97. [112]B. W. Neuman, J. S. Joseph, K. S. Saikatendu, P. Serrano, A. Chatterjee, M. A. Johnson, L. Liao, J. P. Klaus, J. R. Yates, 3rd, K. Wuthrich, R. C. Stevens, M. J. Buchmeier, P. Kuhn, J. Virol. 2008 , 82 , 5279-5294.
  98. [113]P. Serrano, M. A. Johnson, M. S. Almeida, R. Horst, T. Herrmann, J. S. Joseph, B. W. Neuman, V. Subramanian, K. S. Saikatendu, M. J. Buchmeier, R. C. Stevens, P. Kuhn, K. Wuthrich, J. Virol. 2007 , 81 , 12049-12060.
  99. [114]M. P. Egloff, H. Malet, A. Putics, M. Heinonen, H. Dutartre, A. Frangeul, A. Gruez, V. Campanacci, C. Cambillau, J. Ziebuhr, T. Ahola, B. Canard, J. Virol. 2006 , 80 , 8493-8502.
  100. [115]K. S. Saikatendu, J. S. Joseph, V. Subramanian, T. Clayton, M. Griffith, K. Moy, J. Velasquez, B. W. Neuman, M. J. Buchmeier, R. C. Stevens, P. Kuhn, Structure 2005 , 13 , 1665-1675.
  101. [116]J. Tan, Y. Kusov, D. Mutschall, S. Tech, K. Nagarajan, R. Hilgenfeld, C. L. Schmidt, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2007 , 364 , 877-882.
  102. [117]N. Barretto, D. Jukneliene, K. Ratia, Z. Chen, A. D. Mesecar, S. C. Baker, Adv. Exp. Med. Biol. 2006 , 581 , 37-41.
  103. [119]V. N. Chouljenko, X. Q. Lin, J. Storz, K. G. Kousoulas, A. E. Gorbalenya, J. Gen. Virol. 2001 , 82 , 2927-2933.
  104. [120]J. Lei, J. R. Mesters, C. Drosten, S. Anemuller, Q. Ma, R. Hilgenfeld, Antiviral. Res. 2014 , 109 , 72-82.
  105. [121]B. A. Bailey-Elkin, R. C. Knaap, G. G. Johnson, T. J. Dalebout, D. K. Ninaber, P. B. van Kasteren, P. J. Bredenbeek, E. J. Snijder, M. Kikkert, B. L. Mark, J. Biol. Chem. 2014 , 289 , 34667-34682.
  106. [122]A. C. Faesen, M. P. Luna-Vargas, T. K. Sixma, Biochem Soc Trans 2012 , 40 , 539-545.
  107. [123]C. Y. Chou, C. H. Chien, Y. S. Han, M. T. Prebanda, H. P. Hsieh, B. Turk, G. G. Chang, X. Chen, Biochem Pharmacol 2008 , 75 , 1601-1609.
  108. [124]K. W. Cheng, S. C. Cheng, W. Y. Chen, M. H. Lin, S. J. Chuang, I. H. Cheng, C. Y. Sun, C. Y. Chou, Antiviral. Res. 2015 , 115 , 9-16.
  109. [125]M. Frieman, D. Basu, K. Matthews, J. Taylor, G. Jones, R. Pickles, R. Baric, D. A. Engel, PLoS One 2011 , 6 , e28479.
  110. [126]J. Y. Park, J. H. Kim, Y. M. Kim, H. J. Jeong, D. W. Kim, K. H. Park, H. J. Kwon, S. J. Park, W. S. Lee, Y. B. Ryu, Bioorg. Med. Chem. 2012 , 20 , 5928-5935.
  111. [127]J. Y. Park, H. J. Jeong, J. H. Kim, Y. M. Kim, S. J. Park, D. Kim, K. H. Park, W. S. Lee, Y. B. Ryu, Biol Pharm Bull 2012 , 35 , 2036-2042.
  112. [128]J. K. Cho, M. J. Curtis-Long, K. H. Lee, D. W. Kim, H. W. Ryu, H. J. Yuk, K. H. Park, Bioorg. Med. Chem. 2013 , 21 , 3051-3057.
  113. [129]H. Lee, H. Lei, B. D. Santarsiero, J. L. Gatuz, S. Cao, A. J. Rice, K. Patel, M. Z. Szypulinski, I. Ojeda, A. K. Ghosh, M. E. Johnson, ACS Chem. Biol. 2015 , 10 , 1456-1465.
  114. [130]B. Vastag, JAMA 2003 , 290 , 1695-1696.
  115. [132]R. V. Rajnarayanan, S. Dakshanamurthy, N. Pattabiraman, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004 , 321 , 370-378.
  116. [133]L. Chen, C. Gui, X. Luo, Q. Yang, S. Gunther, E. Scandella, C. Drosten, D. Bai, X. He, B. Ludewig, J. Chen, H. Luo, Y. Yang, J. Zou, V. Thiel, K. Chen, J. Shen, X. Shen, H. Jiang, J. Virol. 2005 , 79 , 7095-7103.
  117. [134]Z. Liu, C. Huang, K. Fan, P. Wei, H. Chen, S. Liu, J. Pei, L. Shi, B. Li, K. Yang, Y. Liu, L. Lai, J Chem Inf Model 2005 , 45 , 10-17.
  118. [135]J. Cinatl, B. Morgenstern, G. Bauer, P. Chandra, H. Rabenau, H. W. Doerr, Lancet 2003 , 361 , 2045-2046.
  119. [136]G. Hoever, L. Baltina, M. Michaelis, R. Kondratenko, G. A. Tolstikov, H. W. Doerr, J. Cinatl, Jr., J. Med. Chem. 2005 , 48 , 1256-1259.
  120. [137]T. E. Lane, A. D. Paoletti, M. J. Buchmeier, J. Virol. 1997 , 71 , 2202-2210.
  121. [138]S. Akerstrom, M. Mousavi-Jazi, J. Klingstrom, M. Leijon, A. Lundkvist, A. Mirazimi, J. Virol. 2005 , 79 , 1966-1969.
  122. [139]N. Yamamoto, R. Yang, Y. Yoshinaka, S. Amari, T. Nakano, J. Cinatl, H. Rabenau, H. W. Doerr, G. Hunsmann, A. Otaka, H. Tamamura, N. Fujii, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004 , 318 , 719-725.
  123. [140]C. J. Wu, J. T. Jan, C. M. Chen, H. P. Hsieh, D. R. Hwang, H. W. Liu, C. Y. Liu, H. W. Huang, S. C. Chen, C. F. Hong, R. K. Lin, Y. S. Chao, J. T. Hsu, Antimicrob. Agents. Chemother. 2004 , 48 , 2693-2696.
  124. [141]E. Keyaerts, L. Vijgen, P. Maes, J. Neyts, M. Van Ranst, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004 , 323 , 264-268.
  125. [142]M. Wang, R. Cao, L. Zhang, X. Yang, J. Liu, M. Xu, Z. Shi, Z. Hu, W. Zhong, G. Xiao, Cell. Res. 2020 , 30 , 269-271.
  126. [143]G. Koren, S. King, S. Knowles, E. Phillips, CMAJ 2003 , 168 , 1289-1292.
  127. [144]U. Stroher, A. DiCaro, Y. Li, J. E. Strong, F. Aoki, F. Plummer, S. M. Jones, H. Feldmann, J. Infect. Dis. 2004 , 189 , 1164-1167.
  128. [145]B. Morgenstern, M. Michaelis, P. C. Baer, H. W. Doerr, J. Cinatl, Jr., Biochem. Biophys. Res. Commun. 2005 , 326 , 905-908.
  129. [147]K. Stadler, H. R. Ha, V. Ciminale, C. Spirli, G. Saletti, M. Schiavon, D. Bruttomesso, L. Bigler, F. Follath, A. Pettenazzo, A. Baritussio, Am. J. Respir. Cell. Mol. Biol. 2008 , 39 , 142-149.
  130. [148]J. Dyall, C. M. Coleman, B. J. Hart, T. Venkataraman, M. R. Holbrook, J. Kindrachuk, R. F. Johnson, G. G. Olinger, Jr., P. B. Jahrling, M. Laidlaw, L. M. Johansen, C. M. Lear-Rooney, P. J. Glass, L. E. Hensley, M. B. Frieman, Antimicrob. Agents. Chemother. 2014 , 58 , 4885-4893.
  131. [149]C. M. Coleman, J. M. Sisk, R. M. Mingo, E. A. Nelson, J. M. White, M. B. Frieman, J. Virol. 2016 , 90 , 8924-8933.
  132. [150]A. Zumla, J. F. Chan, E. I. Azhar, D. S. Hui, K. Y. Yuen, Nat. Rev. Drug. Discov. 2016 , 15 , 327-347.
  133. [151]C. K. Chang, S. C. Lo, Y. S. Wang, M. H. Hou, Drug. Discov. Today 2016 , 21 , 562-572.
  134. [152]W. Li, M. J. Moore, N. Vasilieva, J. Sui, S. K. Wong, M. A. Berne, M. Somasundaran, J. L. Sullivan, K. Luzuriaga, T. C. Greenough, H. Choe, M. Farzan, Nature 2003 , 426 , 450-454.
  135. [154]D. Wrapp, N. Wang, K. S. Corbett, J. A. Goldsmith, C. L. Hsieh, O. Abiona, B. S. Graham, J. S. McLellan, Science 2020 , 367 , 1260-1263.
  136. [155]X. Tian, C. Li, A. Huang, S. Xia, S. Lu, Z. Shi, L. Lu, S. Jiang, Z. Yang, Y. Wu, T. Ying, Emerg. Microbes. Infect. 2020 , 9 , 382-385.
  137. [156]L. Yi, Z. Li, K. Yuan, X. Qu, J. Chen, G. Wang, H. Zhang, H. Luo, L. Zhu, P. Jiang, L. Chen, Y. Shen, M. Luo, G. Zuo, J. Hu, D. Duan, Y. Nie, X. Shi, W. Wang, Y. Han, T. Li, Y. Liu, M. Ding, H. Deng, X. Xu, J. Virol. 2004 , 78 , 11334-11339.
  138. [157]G. Simmons, D. N. Gosalia, A. J. Rennekamp, J. D. Reeves, S. L. Diamond, P. Bates, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005 , 102 , 11876-11881.
  139. [158]A. O. Adedeji, W. Severson, C. Jonsson, K. Singh, S. R. Weiss, S. G. Sarafianos, J. Virol. 2013 , 87 , 8017-8028.
  140. [159]M. Kandeel, M. Yamamoto, A. Al-Taher, A. Watanabe, K. Oh-Hashi, B. K. Park, H. J. Kwon, J. I. Inoue, M. Al-Nazawi, Biomol. Ther. (Seoul) 2020 , doi: 10.4062/biomother.2019.202. · DOI
  141. [160]M. Kawase, K. Shirato, L. van der Hoek, F. Taguchi, S. Matsuyama, J. Virol. 2012 , 86 , 6537-6545.
  142. [163]A. A. Elfiky, A. Ismail, Life Sci. 2019 , 238 , 116958.
  143. [164]T. P. Sheahan, A. C. Sims, S. R. Leist, A. Schafer, J. Won, A. J. Brown, S. A. Montgomery, A. Hogg, D. Babusis, M. O. Clarke, J. E. Spahn, L. Bauer, S. Sellers, D. Porter, J. Y. Feng, T. Cihlar, R. Jordan, M. R. Denison, R. S. Baric, Nat. Commun. 2020 , 11 , 222.
  144. [166]M. J. Vincent, E. Bergeron, S. Benjannet, B. R. Erickson, P. E. Rollin, T. G. Ksiazek, N. G. Seidah, S. T. Nichol, Virol. J. 2005 , 2 , 69.
  145. [167]J. Gao, Z. Tian, X. Yang, Biosci. Trends 2020 , 14 , 72-73.
  146. [169]A. M. Jorge, R. B. Melles, Y. Zhang, N. Lu, S. K. Rai, L. H. Young, K. H. Costenbader, R. Ramsey-Goldman, S. S. Lim, J. M. Esdaile, A. E. Clarke, M. B. Urowitz, A. Askanase, C. Aranow, M. Petri, H. Choi, Arthritis. Res. Ther. 2018 , 20 , 133.
  147. [170]X. Yao, F. Ye, M. Zhang, C. Cui, B. Huang, P. Niu, X. Liu, L. Zhao, E. Dong, C. Song, S. Zhan, R. Lu, H. Li, W. Tan, D. Liu, Clin. Infect Dis. 2020 , DOI: 10.1093/cid/ciaa1237.. · DOI

Authors
Ghosh, A. K., Brindisi, M., Shahabi, D., Chapman, M. E., & Mesecar, A. D.
Affiliations
Purdue University West Lafayette (US)
Corresponding author
Ghosh, Arun K.
ORCID
Venue
ChemMedChem
Publisher
Wiley
Published
2020-05-07
Volume
15
Issue
11
Pages
907-932
ISSN
  • 1860-7179 (ISSN-L)
  • 1860-7187
DOI
10.1002/cmdc.202000223
PMC
PMC7264561
OpenAlex
W3019998044
Cited by
306
References
170
Citations by year
2026: 11 · 2025: 23 · 2024: 25 · 2023: 38 · 2022: 53 · 2021: 95 · 2020: 59 · 2012: 1
FWCI
3.09
Type
journal article
Language
en
Open access
Licence
onlinelibrary.wiley.com/termsAndConditions#vor (vor)
Locations
  • ChemMedChem (publishedVersion)
  • PubMed Central (publishedVersion)
  • PubMed (publishedVersion)
Funders
  • National Institutes of Health (AI150466)
  • Purdue University
Topics
  • Health Sciences › Medicine › Infectious Diseases › SARS-CoV-2 and COVID-19 Research
  • Physical Sciences › Computer Science › Computational Theory and Mathematics › Computational Drug Discovery Methods
  • Health Sciences › Medicine › Infectious Diseases › COVID-19 Clinical Research Studies
Keywords
SARS-CoV-2, COVID-19 treatment, antiviral drug discovery, SARS-CoV, MERS-CoV, spike protein, proteolytic enzymes, RNA-dependent RNA polymerase, high-throughput screening
MeSH terms
Drug Development, COVID-19, Antiviral Agents, Chemistry, Pharmaceutical, Humans, Models, Molecular, Pneumonia, Viral, Protease Inhibitors, Coronavirus Infections, Drug Discovery, Pandemics

About these checks

Registry, retraction, Cites and statistics results are computed, not judged, with one exception: a printed reference that no index lists is read once by a model before it counts as a citation error. Claims are extracted by a model and kept only when their quote appears verbatim in the text; each cited source is then checked, with a model’s help, for whether it says what the claim relies on. Those verdicts can be wrong — read the claim’s quote and the cited source before relying on one.

Statistics and arithmetic are recomputed, not judged.

Confidence bands are shown only for fields calibrated on our annotated test set. None is calibrated yet, so no band is shown.

What counts as a claim ›How we measure confidence ›How we check this ›

Are you an author, or do you see a problem with this page? Request a review