Chromatin organization marks exon-intron structure

Schwartz, Schraga, Meshorer, Eran, Ast, Gil·2009·Nature Structural & Molecular Biology
DOI 10.1038/nsmb.1659

Cited by (635)

Items 601–635 of 635

  1. Additional file 5 of NucHMM: a method for quantitative modeling of nucleosome organization identifying functional nucleosome states distinctly associated with splicing potentiality
    Fang, Kun, Li, Tianbao, Yufei Huang, Jin, Victor X. · 2021 · Figshare
  2. Additional file 1 of The transcriptional trajectories of pluripotency and differentiation comprise genes with antithetical architecture and repetitive-element content
    Aristeidis G. Telonis, Isidore Rigoutsos · 2021 · Figshare
  3. Additional file 1 of CREaTor: zero-shot cis-regulatory pattern modeling with attention mechanisms
    Li, Yongge, Ju, Fusong, Chen, Zhiyuan, Yiming Qu, Xia, Huanhuan, He, Liang, Wu, Lijun, Zhu, Jianwei, Shao, Bin, Deng, Pan · 2023 · Figshare
  4. Additional file 3 of CREaTor: zero-shot cis-regulatory pattern modeling with attention mechanisms
    Li, Yongge, Ju, Fusong, Chen, Zhiyuan, Yiming Qu, Xia, Huanhuan, He, Liang, Wu, Lijun, Zhu, Jianwei, Shao, Bin, Deng, Pan · 2024 · Figshare
  5. Additional file 1 of NucHMM: a method for quantitative modeling of nucleosome organization identifying functional nucleosome states distinctly associated with splicing potentiality
    Fang, Kun, Li, Tianbao, Yufei Huang, Jin, Victor X. · 2021 · Figshare
  6. Chromatin state dynamics during the Plasmodium falciparum intraerythrocytic development cycle
    A. J. BROWN, Manuel Llinás, Shaun Mahony · 2026 · BMC Genomics
  7. Differential nucleosome organization in human interphase and metaphase chromosomes
    Keren Li, Irem Ünlü, Yiren Tu, Lilien N. Voong, Yanyan Lu, Brody Kendall, Xiaotian Ma, Sin Lei Pui, Tao Meng, Ji-Ping Wang et al. · 2026 · Molecular Systems Biology
  8. Etude de séquences cis-régulatrices d'épissage dans le gène DMD : rôle dans la régulation des pseudoexons et intérêt pour le saut d'exon thérapeutique.
    Mouna Messaoud Khelifi · 2010 · theses.fr (ABES)
  9. Caractérisation de nouvelles fonctions du facteur d’épissage B52 dans la transcription et la croissance cellulaire chez la drosophile
    Céline Fernando · 2011 · theses.fr (ABES)
  10. Epigenetic landscape of normal and malignant lympho-hematopoiesis : interplays between chromatin signature and tissue specific gene expression
    Aleksandra Pękowska · 2011 · theses.fr (ABES)
  11. Rôle et contexte transcriptionnel du facteur de transcription Ets1 au cours transition CD4- CD8- à CD4+ CD8+ de la tymopoïèse αβ
    Pierre Cauchy · 2010 · theses.fr (ABES)
  12. Alternative splicing of LMNA gene : lessons from a new mouse model of Hutchinson-Gilfort progeria syndrome
    Isabel C. López‐Mejía · 2011 · theses.fr (ABES)
  13. Implication de ROQUIN dans la physiopathologie du lymphome T angio-immunoblastique
    Tiphanie Auguste · 2012 · theses.fr (ABES)
  14. Une nouvelle fonction pour la DEAD-box ARN hélicase p68/DDX5 dans la Dystrophie Myotonique de type 1
    François-Xavier Laurent · 2011 · theses.fr (ABES)
  15. Etude de la structure et de l'origine des ADN circulants : application à la mise au point d'un test de détection des mutations KRAS et BRAF dans le cancer colorectal
    Florent C. Mouliere · 2012 · theses.fr (ABES)
  16. Bioinformatique et épissage dans les pathologies humaines
    François-Olivier Desmet · 2010 · theses.fr (ABES)
  17. Cycline G, contrôle de la transcription et stabilité du développement
    Delphine Dardalhon-Cuménal · 2015 · theses.fr (ABES)
  18. Mécanismes moléculaires à l'origine de la dysautonomie familiale
    Mylène Hervé · 2016 · theses.fr (ABES)
  19. Advances in analytical methodologies for the characterization and quantification in proteomic analysis
    Diego Bertaccini · 2014 · theses.fr (ABES)
  20. Régulation de l'expression des immunoglobulines au cours du développement lymphocytaire B tardif
    Mohamad Omar Ashi · 2018 · theses.fr (ABES)
  21. Vers l'identification des facteurs impliqués dans la régulation concertée des gènes soumis à empreinte dans le cerveau
    Jil Cercy · 2019 · theses.fr (ABES)
  22. Biais de composition nucléotidique des gènes et épissage alternatif
    Sébastien Lemaire · 2019 · theses.fr (ABES)
  23. Rôles de HELLS dans la méthylation de l'ADN et la réponse immune humorale dans un modèle murin du syndrome ICF (Immunodéficit, instabilité Centromérique, et anomalies Faciales)
    Eléonore Mulot · 2020 · theses.fr (ABES)
  24. Étude de l’épissage alternatif des transcrits induits par Aire dans le thymus
    Francine Padonou · 2020 · theses.fr (ABES)
  25. Impact des immunoglobulines tronquées produites par saut d’exon dans les plasmocytes : vers des approches thérapeutiques utilisant des oligonucléotides antisens
    Jean-Marie Lambert · 2020 · theses.fr (ABES)
  26. The role of the HIRA complex coordinating new and old histones dynamics during transcription
    Júlia Torné · 2020 · theses.fr (ABES)
  27. The role of histone modifications in the regulation of alternative splicing during epithelial-to-mesenchymal transition
    Alexandre Segelle · 2020 · theses.fr (ABES)
  28. Contrôle de l'expression génique par la RNP 7SK
    Cécilia Studniarek · 2019 · theses.fr (ABES)
  29. The Role of Convergent Transcription in Regulating Alternative Splicing : Targeted Epigenetic Modification via Repurposed CRISPR/Cas9 System and Its Impact on Alternative Splicing Modulation
    Jia Yi · 2020 · theses.fr (ABES)
  30. Contributions of DNA mechanics and trans-regulation to nucleosome positioning in Schizosaccharomyces pombe and its role in co-transcriptional splicing
    Guoqing Liu, Jing CANG, Zhihao Du, Xiangjun Cui, Hongyu Zhao, Jia Liu · 2026 · Epigenetics & Chromatin
  31. Isoforms in action: The impact of transcript diversity in phenotype
    Izabela Mamede, Carlos Mata-Machado, Clarisse Rezende Reis, Paulo Amaral, Gloria R. Franco · 2026 · Genetics and Molecular Biology
  32. The splice of life: an isoform-centric view of disease, technology, and therapeutics
    Timothy Pan, Lina Lu, Ruli Gao · 2026 · Journal of Clinical Investigation
  33. Association of hybridization and genome doubling with codon usage landscapes in the subgenomes of bread wheat
    Xingchen Li, Mengyao Li, Yongchao Hao, Chengyu Liu, Yuhang Gao, Conghui Jiang, Xueqiang Wang, Muhammad Abdul Rehman Rashid, Yan Zhao · 2026 · Frontiers in Plant Science
  34. Comprehensive Characterization of PEBP Genes Reveals Their Roles in Tuber Development and Stress Responses in Yam
    Qinghua Qiao, GOU Ling, Meiling Chen, Sheng Furui, Gao Liujuan, Ren Zhenxin · 2026 · Research Square
  35. Can We Understand Parameter Values in the Human Genome?
    Wentian Li · 2013 · Springer proceedings in complexity