A Large Fraction of Extragenic RNA Pol II Transcription Sites Overlap Enhancers

De Santa, Francesca, Barozzi, Iros, Mietton, Flore, Ghisletti, Serena, Polletti, Sara, Tusi, Betsabeh Khoramian, Muller, Heiko, Ragoussis, Jiannis, Wei, Chia-Lin, Natoli, Gioacchino·2010·PLoS Biology
DOI 10.1371/journal.pbio.1000384

Cited by (934)

Items 901–934 of 934

  1. Decoding the impact of promoter sequences on transcriptional dynamics in vivo
    Kervy Carola Fernandez Oliveros · 2019 · theses.fr (ABES)
  2. Etude du rôle de la protéine kinase DCLK3 dans les mécanismes de neurodégénérescence dans la maladie de Huntington
    Lucie de Longprez · 2018 · theses.fr (ABES)
  3. Nuclear organization and regulation of gene expression in mouse Embryonic Stem Cells by long non-coding RNAs
    Alexandra Tachtsidi · 2018 · theses.fr (ABES)
  4. Etudes des éléments cis-régulateurs : identification et caractérisation
    Jeanne Chèneby · 2019 · theses.fr (ABES)
  5. Transcriptional regulation of the IgH locus during class switch recombination
    Rocio Amoretti Villa · 2019 · theses.fr (ABES)
  6. Rôle des altérations transcriptionnelles et épigénétiques dans les déficits comportementaux de la maladie de Huntington
    Caroline Lotz · 2019 · theses.fr (ABES)
  7. Identification and characterization of Polycomb repressed gene-enhancer loops
    Charbel Souaid · 2019 · theses.fr (ABES)
  8. Generation of antisense RNAs at convergent gene loci in cells undergoing senescence
    Maharshi Krishna Deb · 2016 · theses.fr (ABES)
  9. Décryptage de dynamiques épigénomiques au cours de la thymopoïèse et de la spermatogenèse en appliquant une méthodologie de recherche reproductible à des données de séquençage à haut débit
    Guillaume Charbonnier · 2019 · theses.fr (ABES)
  10. Etude des éléments régulateurs de l'expression des gènes chez l'humain
    Chloé Bessière · 2018 · theses.fr (ABES)
  11. Epigenetic regulation by estrogen receptor in breast cancer cells
    Athéna Sklias · 2019 · theses.fr (ABES)
  12. Clonally variant non-coding RNA family and its role in Plasmodium falciparum antigenic variation
    Anna Barcons-Simon · 2019 · theses.fr (ABES)
  13. Cellular and molecular mechanisms underlying the role played by the MEN1 gene in prostate cancer cells
    Yakun Luo · 2021 · theses.fr (ABES)
  14. Rôle et détection des enhancers au cours de la différentiation normale et en contexte leucémique
    Léo Pioger · 2020 · theses.fr (ABES)
  15. Contrôle de l'expression génique par la RNP 7SK
    Cécilia Studniarek · 2019 · theses.fr (ABES)
  16. Partenaires moléculaires et fonctions circadiennes hypophysaires du long ARN non codant Neat1
    Audrey Jacq · 2021 · theses.fr (ABES)
  17. Leveraging combinations of epigenomic regulators
    Quentin Ferré · 2021 · theses.fr (ABES)
  18. Gene coregulation in cis within the 3D genome – A single-molecule imaging study
    Maciej A. Kerlin · 2021 · theses.fr (ABES)
  19. L’hétérochromatine duale H3K9me3/H3K36me3 dépendante de SETDB1 et des NSDs assure l’expression des gènes en maintenant les enhancers inactifs
    Amandine Barral · 2021 · theses.fr (ABES)
  20. Rôles de très longs ARNs non codants intergéniques dans la réorganisation 3D du génome au cours de la sénescence
    Julien Ouvrard · 2023 · theses.fr (ABES)
  21. Régulation de la chromatine par SMCHD1 : implication dans la dystrophie facio-scapulo-humérale et le syndrome d'arhinie et de microphtalmie de Bosma
    Camille Laberthonnìère · 2021 · theses.fr (ABES)
  22. Evolution of the eye in Astyanax mexicanus : contribution of maternal and early developmental regulations
    Julien Leclercq · 2022 · theses.fr (ABES)
  23. Epigenetic characterization of cellular pliancy in breast cancer
    Rahma Benhassoun · 2024 · theses.fr (ABES)
  24. Comprehensive mapping of human genetic variation at Epromoters
    Jing Wan · 2024 · theses.fr (ABES)
  25. Mapping active cis-regulatory elements from transcription initiation events
    Hjörleifur Einarsson, Natsuda Navamajiti, Christian Vaagensø, Stefano Pellegrini, Lykke Jirström, Nicolás Alcaraz, Malte Thodberg, Daniel Solvie, Wei‐Lin Qiu, Maya U. Sheth et al. · 2026 · bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
  26. Emergence of protein-coding enhancer RNAs in primate evolution
    Monica Valencia Gattas, Ramin Shiekhattar · 2026 · Trends in Genetics
  27. Enhancer RNA transcription near segmentation gene enhancers can be analyzed in situ using FISH
    Christine Mau, Benjamin Schmid, Ezzat El‐Sherif · 2026 · G3 Genes Genomes Genetics
  28. eRNAformer enables genome-wide de novo mapping of enhancer-derived RNA loci
    Hua Yu, W C Li, W C Li, Yunjie Liu, Yuehua Chen, Xinwen Zhang, Siyue He, Zhiming Chen, Huiquan Wang, Jiajun Ni et al. · 2026 · bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
  29. Frequent Functional Orthology of Characterized Long Noncoding RNAs and Genomic Loci Associated with Complex Traits and Disorders
    Mitchell J Cummins, John S. Mattick · 2026 · Molecular and Cellular Biology
  30. hnRNPK condensates facilitate enhancer–promoter looping and RNA polymerase II recruitment
    Rong Ye, Hailian Zhao, Juan Chen, Qigui Wu, Di Wang, Zhaokui Cai, Ruoyan Wang, Jingxin Li, Tiantian Cheng, Ming Zhang et al. · 2026 · Nature Genetics
  31. Mechanistic insights into the transcription-mediated roles of non-coding RNAs in gene regulation
    Kirthana Viswanathan, Pallabi Shaw, Manjari Kiran · 2026 · Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms
  32. Integrative enhancer discovery identifies functional enhancer dependencies in pediatric acute myeloid leukemia
    Leah Schüler, Robert E. Winkler, José Gonçalves-Dias, K Schuschel, Hasan Issa, Lonneke Verboon, Xiaoyan Wei, Ronay Çetin, Yves Matthess, Manuel Kaulich et al. · 2026 · bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
  33. Long Noncoding RNAs: Localization, Structure, and Interactions with Other Molecules
    William A. Haseltine, Roberto Patarca · 2026 · Springer eBooks
  34. Temporal dynamics of intragenic enhancer RNAs regulate Lin28a expression in response to external stimuli in embryonic stem cells
    Hyohi Lee, Min Oh, Jiin Moon, Seunghwa Jeong, Yeonju Jang, Min Hee Lee, Dahun Um, Daeyoup Lee, Tae-Kyung Kim, Seung-Kyoon Kim · 2026 · Nucleic Acids Research